Caso você tenha cadastrado as variações dos produtos e elas estão exibindo na loja fora da ordem, como por exemplo: M, P, G. 

Verifique as seguintes configurações

1 - A ordenação que os atributos foram cadastrados está correto

A exibição das variações na loja virtual se dá através da ordem de cadastro dos atributos. Acesse o menu Catálogo e clique em Atributos, caso os atributos estejam fora da ordem você pode clicar e arrastar para reordenar. 

2 - A seleção dos atributos no cadastro de produtos está na ordem correta

Certifique-se que na hora de cadastrar os produtos, você selecionou os atributos na ordem correta.